Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha1Q60750 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms