Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik1Q60670 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms