Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms