Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms