Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znrf3Q5SSZ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms