Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psme4Q5SSW2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms