Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav8d-2Q5R1B6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav8d-2Q5R1B6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms