Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms