Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RilpQ5ND29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms