Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps41Q5KU39 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps41Q5KU39 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms