Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hs3st6Q5GFD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st6Q5GFD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Hs3st6Q5GFD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hs3st6Q5GFD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hs3st6Q5GFD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms