Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms