Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf608Q56A10 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf608Q56A10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf608Q56A10 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf608Q56A10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms