Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpjQ569L8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms