Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms