Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms