Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q4VA45 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q4VA45 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q4VA45 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q4VA45 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q4VA45 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q4VA45 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q4VA45 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q4VA45 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q4VA45 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q4VA45 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q4VA45 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q4VA45 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q4VA45 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms