Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc84Q4VA36 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc84Q4VA36 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms