Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem171Q4KL18 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms