Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brinp3Q499E0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms