Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms