Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk4Q3V129 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms