Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms