Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms