Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms