Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc114Q3UX62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms