Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim40Q3UWA4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim40Q3UWA4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms