Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate2Q3UW31 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate2Q3UW31 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms