Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms