Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms