Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28047Q3US59 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28047Q3US59 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms