Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam198bQ3UPI1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam198bQ3UPI1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam198bQ3UPI1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam198bQ3UPI1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms