Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc1Q3UPH1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms