Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tmem253Q3UNB8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmem253Q3UNB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmem253Q3UNB8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem253Q3UNB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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