Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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