Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cobll1Q3UMF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms