Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms