Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms