Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed8Q3UHI4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed8Q3UHI4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms