Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms