Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nom1Q3UFM5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nom1Q3UFM5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms