Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U595 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U595 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U595 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U595 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U595 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms