Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms