Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rnf149Q3U2C5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf149Q3U2C5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf149Q3U2C5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms