Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem35bQ3U0Y2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms