Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TraddQ3U0V2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TraddQ3U0V2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms