Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl4Q3TZA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms