Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XylbQ3TNA1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XylbQ3TNA1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms