Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms