Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp39Q3TIX9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms